Cómo factura un fisioterapeuta autónomo en 2026: exención IVA sanitaria, prorrata y ejemplos
"Pero entonces, ¿tengo que cobrar IVA o no en mis facturas?" Es la pregunta que se hacen el 100 % de los fisioterapeutas recién dados de alta. Y la respuesta corta es: casi siempre no, pero hay excepciones que pueden meterte en problemas. Te explico exactamente cuándo aplica la exención del art. 20.1.3 LIVA, qué servicios pierden la exención, cómo se hace el modelo 303 con prorrata si compaginas terapia con masajes de bienestar, qué retención IRPF aplicar y un ejemplo numérico de factura.
Esto que parece complicado tiene una lógica clara cuando lo ves bien estructurado. Vamos.
- La exención del art. 20.1.3 LIVA y qué es "asistencia sanitaria"
- Tres requisitos para aplicar la exención
- Servicios que SÍ llevan IVA (cuidado con esto)
- Ejemplo: factura exenta a paciente particular
- Ejemplo: factura con IVA por masaje wellness
- Modelo 303 con prorrata si tienes los dos casos
- Retención IRPF y modelo 130
- Gastos deducibles del fisio
- VeriFactu 2027 para fisios
- Preguntas frecuentes
La exención del art. 20.1.3 LIVA y qué es "asistencia sanitaria"
La ley clave es el art. 20.Uno.3 de la Ley 37/1992 del IVA. Dice literal:
"Estarán exentas del impuesto las siguientes operaciones: La asistencia a personas físicas por profesionales médicos o sanitarios, cualquiera que sea la persona destinataria de dichos servicios. A efectos de este Impuesto, tendrán la condición de profesionales médicos o sanitarios los considerados como tales en el ordenamiento jurídico y los Psicólogos, Logopedas y Ópticos, diplomados en Centros oficiales o reconocidos por la Administración."
El TJUE (Tribunal de Justicia de la UE) ha matizado mil veces este artículo en sentencias clave (Asunto C-141/00 Kügler, C-307/01 D'Ambrumenil, C-262/08 CopyGene). El criterio definitivo es: la operación debe tener finalidad terapéutica, es decir, diagnóstico, prevención, tratamiento, alivio o curación de enfermedades o problemas de salud.
La fisioterapia colegiada cumple ese criterio claramente. Un paciente con lumbalgia, una recuperación post-quirúrgica, un tratamiento de fascitis plantar — todo eso es asistencia sanitaria exenta. Tu factura va sin IVA.
Tres requisitos para aplicar la exención
Para que tu servicio entre en la exención, hace falta cumplir los tres:
- Profesional médico o sanitario reconocido por la Administración. El fisioterapeuta lo es (Ley 44/2003 de ordenación de las profesiones sanitarias) y debe estar colegiado.
- Persona física como destinataria del servicio. Cuando facturas a una mutua o aseguradora, la jurisprudencia del TS lo ha aceptado igualmente como exento mientras el beneficiario final del servicio sea una persona física.
- Finalidad terapéutica. Diagnóstico, prevención, tratamiento, alivio o curación. Si el servicio es estético, recreativo o de bienestar puro, pierde la exención.
Servicios que SÍ llevan IVA (cuidado con esto)
Aquí está la trampa que te puede costar dinero. Hay servicios que parecen fisio pero la AEAT considera que no son terapéuticos y por tanto llevan IVA 21 %:
| Servicio | ¿Exento? | Motivo |
|---|---|---|
| Sesión de fisio por dolor lumbar | Sí, exento | Tratamiento terapéutico |
| Recuperación post-operatoria | Sí, exento | Recuperación funcional |
| Drenaje linfático tras cirugía | Sí, exento | Indicación médica |
| Masaje relajante o "bienestar" | No, 21 % IVA | Sin finalidad terapéutica |
| Drenaje linfático estético | No, 21 % IVA | Finalidad cosmética |
| Asesoramiento dietético no terapéutico | No, 21 % IVA | Bienestar, no enfermedad |
| Cursos online a particulares | No, 21 % IVA | Formación, no asistencia |
| Peritaje a aseguradora | No, 21 % IVA | Servicio a empresa, no a paciente |
| Venta de productos físicos | No, 21 % IVA | Entrega de bien, no servicio |
| Conferencia remunerada | No, 21 % IVA | Divulgación, no asistencia |
Ejemplo: factura exenta a paciente particular
Sesión de 1 hora con un paciente por dolor cervical. Tarifa 50 EUR.
| Concepto | Importe |
|---|---|
| Sesión de fisioterapia (tratamiento cervicalgia) | 50,00 EUR |
| IVA | 0,00 EUR (exento art. 20.Uno.3 LIVA) |
| Retención IRPF | 0,00 EUR (paciente particular) |
| Total a cobrar | 50,00 EUR |
En la factura tienes que poner literalmente la mención "Operación exenta de IVA según art. 20.Uno.3 LIVA". Si emites factura simplificada (importe inferior a 400 EUR), basta con tu nombre, NIF, fecha, descripción y total. Si emites factura completa, añade los datos del paciente.
Ejemplo: factura con IVA por masaje wellness
Misma fisio, pero esta vez un cliente quiere un masaje de bienestar 1 hora. Tarifa 60 EUR.
| Concepto | Importe |
|---|---|
| Masaje de bienestar (sin indicación terapéutica) | 49,59 EUR |
| IVA 21 % | + 10,41 EUR |
| Total a cobrar | 60,00 EUR |
Aquí ya no aplica la exención. Tu factura lleva IVA 21 %. Lo recoges en modelo 303 trimestral como IVA repercutido y lo ingresas a Hacienda menos el IVA deducible de tus compras (aplicando prorrata si compaginas).
Modelo 303 con prorrata si tienes los dos casos
Aquí está la parte que confunde a la mayoría. Si solo emites operaciones exentas, no tienes que presentar modelo 303 ni recuperar IVA. Pero también pierdes el derecho a deducir el IVA de tus compras (porque tus operaciones no llevan IVA repercutido contra el que compensar).
Si compaginas operaciones exentas (fisio terapéutica) con operaciones con IVA (masajes wellness, cursos, peritaje), aplicas la regla de prorrata del art. 102 LIVA.
Prorrata general (la habitual)
Calculas un porcentaje:
prorrata % = (operaciones con IVA / total operaciones) × 100
Y solo puedes deducir ese porcentaje del IVA soportado en tus compras comunes.
Ejemplo: en el trimestre facturas 9.000 EUR de fisio terapéutica (exenta) y 1.500 EUR de masajes wellness (con IVA). Tu prorrata es: 1.500 / 10.500 = 14,3 %.
Si en ese trimestre has pagado 800 EUR de IVA en compras comunes (camilla, alquiler, papelería), solo puedes deducir 800 × 14,3 % = 114,40 EUR. El resto va a gasto IRPF.
Prorrata especial (alternativa)
Si la prorrata general te perjudica más de un 20 %, puedes acogerte a la prorrata especial: deduces el 100 % del IVA de las compras directamente afectas a operaciones con IVA, el 0 % de las afectas a exentas, y la prorrata general en las comunes. Es más precisa pero requiere identificar cada gasto. Habitual cuando hay claras separaciones (sala de masajes vs sala de fisio).
Facturas exentas y con IVA en un mismo bot
FactuChat detecta el tipo de servicio y aplica automáticamente la mención de exención del art. 20.1.3 LIVA o el 21 % cuando corresponde.
Probar en Telegram →Retención IRPF y modelo 130
Tu epígrafe IAE es el 836 (sección segunda profesional). Esto significa:
- Si facturas a paciente particular: no hay retención.
- Si facturas a una mutua, aseguradora, empresa o clínica: 15 % retención IRPF, o 7 % si estás en los 3 primeros años de alta.
- Presentas modelo 130 trimestral con el pago fraccionado del 20 % sobre tu rendimiento neto, descontando las retenciones ya practicadas.
- En el modelo 100 anual sumas todo y recuperas lo de más o pagas lo de menos.
Gastos deducibles del fisio
- Local: alquiler, suministros (luz, agua, internet), comunidad, IBI proporcional.
- Material: camilla, electroterapia, ecógrafo, kinesio tape, vendajes, cremas, aceites.
- Formación continua: cursos de actualización, congresos, libros técnicos, suscripciones.
- Colegio profesional: cuota colegial.
- Seguro RC: responsabilidad civil profesional (obligatorio).
- Software de gestión clínica: agendamiento, historiales, software facturación VeriFactu.
- Vestuario sanitario: uniforme con logotipo, calzado sanitario.
- Gestor: 100 % deducible.
Recuerda el matiz de prorrata para el IVA. Para el IRPF, todos esos gastos son deducibles al 100 % si están afectos a la actividad. Mira la guía completa de gastos deducibles 2026.
VeriFactu 2027 para fisios
Desde el 1 de julio de 2027 los fisios autónomos están obligados a usar software de facturación adaptado a VeriFactu (RD 1007/2023 modificado por RD 254/2025). Hay un detalle importante:
Mira la comparativa de aplicaciones VeriFactu 2026 para elegir la que mejor se adapte a tu caso. Y la página VeriFactu de FactuChat para entender cómo funciona internamente.
Preguntas frecuentes
¿Un fisioterapeuta autónomo cobra IVA en sus facturas?
Por regla general, no. El art. 20.Uno.3 LIVA exime las prestaciones sanitarias por profesional colegiado con finalidad terapéutica. Tu factura va sin IVA con la mención de la exención.
¿Hay casos en los que SÍ tengo que cobrar IVA?
Sí: masajes wellness sin indicación terapéutica, sesiones estéticas, asesoramiento dietético no terapéutico, cursos online, conferencias, peritajes a aseguradoras, venta de productos físicos. Todo eso va con 21 % IVA.
¿Qué pasa si tengo facturas con y sin IVA?
Aplicas la regla de prorrata del art. 102 LIVA en tu modelo 303 trimestral. Solo deduces el IVA de tus compras comunes en el porcentaje que tus operaciones con IVA representan sobre el total facturado.
¿Qué retención de IRPF aplico?
15 % si facturas a empresario o profesional español (mutuas, gestorías, aseguradoras). 7 % si llevas menos de 3 años de alta y marcas la casilla del 037. 0 % si facturas a paciente particular.
¿Cuál es el epígrafe IAE de fisioterapeuta?
El 836 ('Naturópatas, acupuntores y otros profesionales parasanitarios') de la sección segunda profesional, a pesar de la denominación poco afortunada.
¿Tengo que emitir factura por cada sesión a un particular?
Sí, por cada prestación de servicios (art. 2 RD 1619/2012). Puedes emitir factura simplificada por importe menor de 400 EUR. Tiene que incluir la mención de exención del art. 20.Uno.3 LIVA.
¿Puedo deducir camilla, formación continuada, alquiler del local?
Para el IRPF, sí, todos los gastos afectos a la actividad. Para el IVA, sí pero aplicando prorrata si compaginas exento con IVA. Si toda tu actividad es exenta, no puedes deducir IVA de compras.
¿Cuánto se paga de RETA siendo fisio en 2026?
Depende del rendimiento neto. Para un fisio con 30.000-40.000 EUR de ingresos y 25 % de gastos, la cuota está entre 320-400 EUR/mes. Tarifa plana de 87 EUR los primeros 12 meses si nunca has estado de alta.
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